核酸浓度测定

 

核酸的定量与纯度的测定

在分子生物学实验中,核酸提取需要进行其纯度和浓度的测定。目前实验室常用的测定方法主要有分光光度法、荧光染料法、PCR法和杂交定量法等。

分光光度法

分光光度法主要包括紫外分光光度法、定糖定磷法及基于酶催化的核酸定量方法等。

(1)紫外分光光度法

紫外分光光度法基于DNA链上碱基的苯环结构在紫光区具有较强吸收,DNA/RNA在260nm处有最大的吸收峰,蛋白质在280nm处有最大的吸收峰,盐和小分子则集中在230nm处。因此,可以用260nm波长进行分光测定核酸浓度,OD值为1相当于大约50μg/ml双链DNA,单链DNA浓度约为33μg / ml,RNA约为40μg/ml,寡核苷酸约为35μg/ml。如用1cm光径,用 H2O稀释DNA/RNA样品n倍并以H2O为空白对照,根据此时读出的OD260值即可计算出样品稀释前的浓度:

DNA(mg/ml)=50×OD260读数×稀释倍数/1000

RNA(mg/ml)=40×OD260读数×稀释倍数/1000。

A280nm是蛋白和酚类物质最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA的A260/A280比值为1.8,纯RNA为2.0。假如比值低,表示受到蛋白(芳香族)或分类物质的污染,需要纯化样品。比值=1.5相当于50%蛋白质/DNA溶液。

A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA和RNA的A260/A230比值为2.5。若比值小于2.0标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。

A320nm或A340nm为检测溶液样品的浊度,该值应该接近0.0。假如不足,标明溶液中有悬浮物,需要纯化样品。

实验步骤

1、将制备的DNA悬浮溶解于TE缓冲液中pH8.0,10mmo1/L的Tris缓冲液,内含(1mmol/L EDTA)或悬浮溶解在灭菌水中(依据DNA含量加水)。

2、用可扫描的紫外分光光度计测定制备的DNA/RNA的紫外吸收曲线,测定OD260和OD280,并计算比值:OD260/OD280,纯DNA的此比值约为1.8~2.0。纯RNA的此比值约为大于2.0。

3、根据每毫升1微克的纯DNA的OD260值=0.020,计算所得DNA的纯度;每毫升1微克的纯RNA的OD260值= 0.025,计算所得RNA的纯度。

注意事项

OD值范围应该在0.1~0.99之间,否则不符合上述线性关系。

A260/A280比值可提供DNA纯度的一个参考,但A260/A280 比值会受pH影响。如果未调pH,比值可能与实际差别很大。如果需要准确数值,建议在10 mM Tris Cl,pH 8.5中检测,此时纯净的DNA A260/A280比值应为1.8-2.0(注意应使用同样缓冲液作为对照)。 常见问题分析

1、DNA浓度测定的OD260/OD280比值大于1.8,说明存在RNA,可重新用RNaseA处理,酚:氯仿:异戊醇(23:24:1)抽提;DNA浓度测定的OD260/OD280比值小于1.8,则说明有蛋白质等杂质存在,需再用蛋白酶K、SDS及盼、氯仿、异戊醇重新对DNA进行纯化(也可加入1/8体积的3M NaAc(pH5.2)与冷乙醇一同促使DNA沉淀析出。

RNA浓度测定OD260/OD280比值小于1.8时,说明溶液中蛋白或者时其他有机物的污染比较明显; OD260/OD280比值大于2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了。

2、采用紫外检测法测核酸含量的优缺点:用紫外光吸收法测定样品的核酸含量,具有简单、

www.99jianzhu.com/包含内容:建筑图纸、PDF/word/ppt 流程,表格,案例,最新,免费下载,施工方案、工程书籍、建筑论文、合同表格、标准规范、CAD图纸等内容。


TOP最近更新内容

    园林史名词解释
    长城小学关爱留守儿童工作制度
  • 上一篇:城市规划原理复习资料
  • 下一篇:新课标推荐小学必读书目